MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Campylobacter coli CVM N29710 plasmid pN29710-1

Total Repeats: 222

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022355	A	7	7	1225	1231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022355	AT	3	6	1242	1247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022355	A	7	7	1251	1257	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022355	ATG	2	6	1272	1277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022355	AT	3	6	1297	1302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022355	AAT	3	9	1341	1349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022355	CTA	2	6	1896	1901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_022355	TAA	2	6	1908	1913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022355	TAA	2	6	1925	1930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022355	AT	4	8	1937	1944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022355	TAAT	2	8	1945	1952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022355	TTAAT	3	15	1948	1962	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022355	TAA	2	6	1965	1970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022355	ATA	2	6	1971	1976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022355	TA	3	6	1978	1983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022355	TA	4	8	1986	1993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022355	GAG	2	6	2012	2017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022355	A	9	9	2033	2041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022355	A	6	6	2047	2052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022355	TAG	2	6	2433	2438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022355	T	6	6	2452	2457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022355	TAG	2	6	2479	2484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022355	GAT	2	6	2492	2497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022355	TTAT	2	8	2533	2540	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022355	TTA	2	6	2548	2553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022355	ATT	2	6	2625	2630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022355	T	6	6	2673	2678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022355	AAAT	2	8	2692	2699	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022355	A	6	6	2732	2737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022355	TATT	2	8	2752	2759	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022355	TGA	2	6	2785	2790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022355	GTT	2	6	2840	2845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022355	T	6	6	2870	2875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022355	AGG	2	6	2916	2921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022355	TTA	2	6	3759	3764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022355	TA	3	6	3776	3781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022355	A	6	6	3799	3804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022355	T	7	7	3807	3813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022355	ATA	2	6	3817	3822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022355	TGT	2	6	3825	3830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022355	A	6	6	3835	3840	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022355	GGT	2	6	3841	3846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022355	A	6	6	4665	4670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022355	A	7	7	4697	4703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022355	GAA	2	6	4784	4789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022355	CAT	2	6	10530	10535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_022355	CAT	2	6	10560	10565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_022355	GAC	2	6	10577	10582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_022355	TAA	2	6	10600	10605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022355	TTTTA	2	10	11359	11368	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022355	AAAC	2	8	11371	11378	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_022355	ATTT	2	8	11417	11424	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022355	AGC	2	6	11436	11441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_022355	TTTA	2	8	11448	11455	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022355	CTT	2	6	11501	11506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_022355	CTT	2	6	11555	11560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_022355	TAT	2	6	11621	11626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022355	TA	3	6	11654	11659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022355	TCT	2	6	11667	11672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_022355	TTC	2	6	11691	11696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_022355	ATTA	2	8	11766	11773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022355	AGA	2	6	11820	11825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022355	TAAC	2	8	11851	11858	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_022355	ATT	2	6	11897	11902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022355	T	6	6	11907	11912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022355	T	6	6	11956	11961	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022355	CCT	2	6	11964	11969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_022355	CTT	2	6	12007	12012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_022355	T	7	7	12019	12025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022355	ATT	2	6	12063	12068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022355	TA	3	6	12078	12083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022355	T	6	6	14068	14073	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022355	ATT	2	6	14121	14126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022355	ATT	2	6	14147	14152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022355	ACT	2	6	14173	14178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_022355	ATA	2	6	14184	14189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022355	AAG	2	6	14588	14593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022355	TAAA	2	8	14627	14634	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022355	T	6	6	14635	14640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022355	A	7	7	14679	14685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022355	AT	3	6	14700	14705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022355	ATT	2	6	14716	14721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022355	A	6	6	14732	14737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022355	TAAT	2	8	14792	14799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022355	A	7	7	14845	14851	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022355	AAT	2	6	14858	14863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022355	ATG	2	6	14892	14897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022355	A	6	6	14926	14931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022355	TAA	2	6	14947	14952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022355	A	8	8	15015	15022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022355	TAA	2	6	15028	15033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022355	A	6	6	15032	15037	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022355	T	7	7	15041	15047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022355	A	6	6	15052	15057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022355	TGAA	2	8	15058	15065	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022355	A	9	9	15072	15080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022355	TAAA	2	8	15082	15089	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022355	A	6	6	15118	15123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022355	A	6	6	15142	15147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022355	AAT	2	6	15150	15155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022355	ATA	3	9	15205	15213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022355	ATT	2	6	15279	15284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022355	ATA	2	6	15301	15306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022355	A	6	6	15335	15340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022355	A	7	7	15360	15366	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022355	AG	3	6	15386	15391	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022355	A	7	7	15392	15398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022355	ATT	2	6	15448	15453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022355	TTA	2	6	15458	15463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022355	A	6	6	15498	15503	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022355	CAAT	2	8	15522	15529	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_022355	ATA	2	6	15530	15535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022355	A	6	6	15549	15554	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022355	A	7	7	15559	15565	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022355	AT	4	8	15578	15585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022355	TTA	2	6	15607	15612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022355	ACA	2	6	15658	15663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_022355	A	7	7	15665	15671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022355	AAC	2	6	15693	15698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_022355	TA	3	6	15715	15720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022355	GAT	2	6	15754	15759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022355	TTAA	2	8	15760	15767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022355	TGA	2	6	15774	15779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022355	A	7	7	15856	15862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022355	AT	3	6	17141	17146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022355	ATA	2	6	17149	17154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022355	TA	3	6	17153	17158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022355	T	6	6	17165	17170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022355	AT	3	6	17171	17176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022355	TAA	2	6	17184	17189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022355	TAT	2	6	17195	17200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022355	A	7	7	17218	17224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022355	A	7	7	17542	17548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022355	A	6	6	17556	17561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022355	TTA	2	6	17562	17567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022355	ATTTCT	2	12	17933	17944	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_022355	T	6	6	17969	17974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022355	AATTTT	2	12	17991	18002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022355	TAA	2	6	18032	18037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022355	T	7	7	18076	18082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022355	TTG	2	6	18202	18207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022355	A	6	6	18251	18256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022355	TGC	2	6	18266	18271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_022355	ATTT	2	8	18302	18309	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022355	T	6	6	18351	18356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022355	TA	3	6	20595	20600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022355	TA	3	6	20625	20630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022355	T	6	6	20643	20648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_022355	TTA	2	6	20675	20680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_022355	T	6	6	20686	20691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_022355	TAAA	2	8	20702	20709	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_022355	TAA	2	6	22069	22074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_022355	A	6	6	22083	22088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_022355	TAAA	2	8	22100	22107	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_022355	AAT	2	6	22116	22121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_022355	ACAAA	2	10	22134	22143	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
157	NC_022355	AATTA	2	10	22144	22153	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_022355	T	7	7	22154	22160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_022355	TAA	3	9	22164	22172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_022355	T	7	7	22193	22199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_022355	CAA	2	6	26389	26394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_022355	TA	3	6	37583	37588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_022355	A	8	8	37590	37597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_022355	A	6	6	37601	37606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_022355	A	6	6	37608	37613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_022355	A	6	6	37631	37636	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_022355	TTA	3	9	38300	38308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_022355	TTA	2	6	38310	38315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_022355	TAA	2	6	41201	41206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_022355	ATTT	2	8	41213	41220	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_022355	TAAT	2	8	41221	41228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_022355	TAA	2	6	41231	41236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_022355	ATA	2	6	41237	41242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_022355	T	6	6	41282	41287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_022355	GAG	2	6	41290	41295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
176	NC_022355	ACAA	2	8	42749	42756	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
177	NC_022355	TAC	2	6	42810	42815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
178	NC_022355	GCT	2	6	42889	42894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
179	NC_022355	TTTCCG	2	12	42907	42918	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
180	NC_022355	A	6	6	42934	42939	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_022355	CGGTG	2	10	43999	44008	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
182	NC_022355	TTC	2	6	44025	44030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
183	NC_022355	CCT	2	6	44032	44037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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185	NC_022355	ACA	2	6	44082	44087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
186	NC_022355	CG	4	8	44115	44122	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
187	NC_022355	TAA	2	6	44134	44139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_022355	T	6	6	44189	44194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_022355	GAA	2	6	44209	44214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
190	NC_022355	ATTTT	2	10	44216	44225	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
191	NC_022355	GAT	2	6	44264	44269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
192	NC_022355	TAT	2	6	44356	44361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_022355	TAA	2	6	44371	44376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_022355	TAAA	2	8	44396	44403	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_022355	T	6	6	44467	44472	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_022355	T	6	6	44597	44602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
197	NC_022355	AGG	2	6	44613	44618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
198	NC_022355	ATC	2	6	46808	46813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
199	NC_022355	A	8	8	46856	46863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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221	NC_022355	AAT	2	6	52907	52912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
222	NC_022355	TCT	2	6	54932	54937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.